Job area
Research & Development
Location
Loos, France
Contract type
Permanent Contract

Job description

La personne recrutée renforcera l’équipe de Data Science et biologie Computationnelle de la R&D. L’équipe se conjugue au pluriel autour des métiers de la data : elle est composée de data manager, statisticien(ne)s, data scientists et biologistes computationel(le)s. 

Elle travaillera au contact de chercheurs, ingénieurs et techniciens de R&D spécialisés notamment en microbiologie, génétique, fermentation, enzymologie, science du pain, chimie analytique, procédés de séparation. 

Elle interagira également en mode projet avec les différentes Business Units et filiales du groupe Lesaffre.

 

Missions principales

–        Designer, déployer, maintenir, améliorer et mettre en œuvre différentes pipelines bioinformatiques pour l’exploitation de données de séquençage à haut débit de milliers de microorganismes à des fins de :

o   Assemblage/reconstruction et annotation de génomes de microorganismes (levures, bactéries, champignons)

o   Identification d’espèce à partir de génome complet ou ARN ribosomique

o   Analyse de variants (SNPs, Indels, CNVs, et variants structuraux)

o   Métagénomique qualitative et quantitative (identification taxonomique, etc.)

o   Analyse d’expression différentielle

o   Analyse d’enrichissement fonctionnelle

o   Établissement de cartes fonctionnelles et détection d’antibiorésistance

–        Etablir des rapports techniques d’analyse de génome en vue de constituer des dossiers réglementaires.

–        Être conseil et support référent des besoins bioinformatiques des collaborateurs en R&D (particulièrement auprès des microbiologistes et généticiens), et des Business Unit du groupe Lesaffre

Autres missions

–        Mener des analyses de génomiques comparatives et phylogénie simples

–        Participer avec un data Manager à la modélisation de données NGS

–        Fouiller des bases de données publiques et/ou privée de séquences

–        Maintenir une veille technique dans votre domaine d’expertise

–        Contribuer en collaboration avec des biologistes computationnels/statisticiens à l’identification de liens génotype-phénotype

–        Encadrer des étudiants/stagiaires et éventuellement d’autres employés dans votre domaine d’expertise

Company description

Acteur mondial de référence dans le domaine des levures et de la fermentation, Lesaffre conçoit, produit et apporte des solutions innovantes pour la panification, le goût & plaisir alimentaire, le bien-être & la santé et la biotechnologie.

Groupe familial, né dans le Nord de la France en 1853, aujourd’hui multi-local et pluriculturel, Lesaffre s’engage à entreprendre avec confiance pour mieux nourrir et protéger la planète.

Proche de ses clients et de ses partenaires, Lesaffre emploie 10500 collaborateurs répartis dans plus de 70 filiales implantées dans une quarantaine de pays.

Lesaffre réalise un chiffre d’affaires 2 milliards d’euros dont plus de 40% dans les pays émergents.